《火焰纹章：圣魔之光石》本作游戏背景设定为新的玛尔维基大陆。游戏的主人公是侠义的王室兄妹伊弗列姆和艾瑞珂。玩家可以扮演他们进行冒险。

游戏剧情

当古拉德王国对自己的盟国鲁内斯发动猛攻并占领之后，伊弗列姆和艾瑞珂是为数不多的幸存者，于是他们肩负起调查古拉德背叛的源头与平息大陆动的重任。体质贫弱的皇子里昂从小就对自己的玩伴，武艺高强的王子伊弗列姆充满了憧憬，在矛盾中，他使用了封印着魔王灵魂的圣石，却被魔王所利用。最后利昂以自己的意识挡在了主角一行面前，激战后确认了朋友的强大，带着悲剧色彩的利昂在友人的怀抱中带着安然的离去。

《圣魔之光石》的主题毫无疑问是友情，到了后期与利昂的几场战斗，这一主题开始明朗化，一段段剧情说明了主角二人和利昂之间深厚的情感。直到结局，那一段利昂的独白更是将“友情”这一游戏主题推向了高潮。